宁志远随即决定对部队进行重组，在宁志远的命令下，新设第一团第四营、第五营、基地守备营、炮兵连、辎重连、宪兵连、团野战医院，警卫连升格为营，同时对营、连、排进行调整：
各班减少两名步枪兵，增加一个两人轻机枪组，人数保持十二人；
排辖三班，无排直属队，每排三十八人；
连辖三排、机炮排、连部，机炮排辖一个轻机枪班（装备三挺捷克式轻机枪，八人）、一个掷弹筒班（三门掷弹筒，八人）、一个弹药输送班（12人），共三十人，连部班包括两名警卫员兼通信员、三名卫生员、一个文书、四个炊事员，每连一百五十六人；
营辖三连，一个重机枪连（包括一个机枪排（4挺马克沁重机枪）及一个弹药排，共九十四人），一个营部排（两名军医、六名卫生员、两个文书、一个10人警卫班、四名通信员、两名炊事员，共二十六人），每营五百九十人；
炮兵连含三个各辖两门山炮的炮兵排及一个弹药排，全连142人（每名炮班只有一半人是普通炮兵，虽然他们并不懂得使用山炮，但是普通炮兵也是炮兵，何况山炮和步兵炮之间实际上是有共通之处的，而且又有蒋柏文这个老炮兵的教导，只要给他们一点时间，他们还是能够掌握这款山炮的操作的）；
辎重连只装备步枪、冲锋枪和手枪，负责全团物资运输，全连180人；
宪兵连同样只装备步枪、冲锋枪和手枪，负责监察军纪，全连120人；
警卫营、基地守备营与步兵营编制相同，此二营为清一色生化人部队，警卫营负责宁志远安全，守备营负责基守完备（其中一个连驻扎在矿区）；
自求军野战医院配医生十二人，护士五十人；
后勤处增加三十名生化人……
七个营即4130人，外加炮兵连、侦察连、辎重连、宪兵连、团野战医院、后勤处等，全团官兵数量达四千八百之众，而目前宁志远手中的全部兵力不过两千两百人，还有一大半的缺口，因而四营、五营、基地守备营还只是一个空架子，二营、三营也暂未满编，唯有一营、警卫营和炮兵连处于满编之中，好在现在两座生化兵营全力暴兵的话，每天有约五百名生化人加入，相信用不了多久，第一团就能够满编了！
此时宁志远也不藏着掖着了，此前为了隐蔽需要，自救军的军事训练都是以体能为主，现在基地的位置已经暴露，再无隐蔽之需要，因而实弹射击便被提上了日程，各营、连、排、班皆在宁志远的命令下就地展开了实弹射击训练，每天，高山草甸子上都会传来不绝于耳的枪炮声（炮是掷弹筒，山炮炮弹数量太小，而且一旦开炮，必然被马鸿逵知悉，作为杀手锏武器，宁志远觉得还是暂时雪藏起来的为好），这样做的结果就是让高山草甸子的鸟兽几乎绝迹、马家军终日惶恐不安以及海量的弹药消耗，当然了，对宁志远来说，些许弹药消耗根本算不得什么！
对于普通人而言，实弹射击不但可以提升命中率，而且还能够使士兵熟悉枪炮声，切身感受战场，好处是显而易见的，而生化人虽然掌握了相关的技能，即使不训练也能够在自己定位的领域做的很好，但正所谓熟能生巧，长期的训练却能够使他们的技能百尺杆头更进一步，因而每天约十万发的子弹及数百枚榴弹的消耗在宁志远看来实在是太划算了！
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