这些都不致命，但真正致命的是，这次十万吨级别的核爆之后，不光是阿图拉岛，就连停泊在港内的军舰，他们所搭载的电子设备遭受了严重的损坏。
舰上搭载的无线电台，晶体设备几乎全部报废，只有部分落后的旧式电子管设备还能使用。而舰上的雷达在这一击下，也多有损坏。而原子弹爆炸造成的电磁紊乱，也让少数还能正常工作的军舰雷达上尽是雪花，根本无法起到预警的效果。
EMP，即电磁脉冲，这是一种物理现象，电磁脉冲主要用于破坏敌人的电子设备，核弹爆发时产生的电磁脉冲，对电子设备，尤其是晶体管电子设备能产生极大的伤害烧毁效果。不仅仅这些脆弱的晶体管电台和使用晶体管的设备，不少军舰正在工作中的发电机线圈，也因为核爆冲击的EMP冲击造成的过载而损坏。
“立刻给其他军舰发电，我们遭受到了敌人的核打击，港内的军舰必须尽快全部疏散。”
意识到自己遭遇核攻击后，哈尔西立刻在第一时间命令港内的军舰疏散。可是这道指令要传达下去，立刻就遭遇了“舰上电台全部损坏，无法使用”的问题。幸运的是，蒙大拿号战列舰由于泊位离爆心较远，舰上的发电机还能正常工作，靠着探照灯的灯光讯号联络周围各舰，总算将指令传达了下去。
只是，用灯光传讯很浪费时间，而庞大的舰队停泊在港口，要紧急启散疏散，不花上几个小时的时间根本不可能做到，而在通讯被严重破坏的时刻，需要消耗的时间就更多了。
过去的几年里，德国方面一直有意地在向美国廉价地抛售大量的晶体管电台成品和零散的晶体管制品。这些轻巧、稳定、能耗低，维护方便的晶体管设备极受美国军方的欢迎，多年下来，几乎所有的军用电台都是晶体设备，而军用的雷达上的零件，同样也有大量从德国进口的晶体管制品。
核爆产生的EMP是晶体管设备最大的杀手，汉娜在多年前就埋下的暗子，终于在这一刻图穷匕首现。
只有部分没有开机，同时又距离较远的军舰上的晶体管设备在这场核爆中逃过一劫，但这并不包括哈尔西所在的旗舰蒙大拿号。为了和外围舰队取得联络，哈尔西将军不得不放弃旗舰，搭载小艇，转移到附近电台还能正常工作的军舰上。
但这依旧要消耗时间，而时间在这个时候是最宝贵的。
具有讽刺意味的是，凌晨三(蟹)点二十五分，在遭遇核爆后第四十分钟，蒙大拿号上的通讯兵总算找到了和其他军舰通过无线电联络的方法：舰上有水兵在混乱中突然想到仓库里还有存放着被淘汰的电子管电台，本着死马当活马医的想法，通讯兵们从角落里找出那个已被打包封存，落满灰尘的电台，一番调试，更换了一些零配件后，又折腾了近十几分钟，总算恢复了无线电通讯联络。（注：老式的真空管电台，放着不用，电子管也容易失效损坏的）
而这个时候，哈尔西刚刚将他的司令部转移到附近的一艘巡洋舰上。当哈尔西正在犹豫是不是要返回旗舰时，巡洋舰上的通讯电台送来一份电报，是来自两百公里外，最外围警戒舰队的电报：内容是核爆发生前三分钟，外围舰队发现在西北方被重点监视的科曼多群岛方向，出现了大量的雷达讯号，疑似是从那儿的苏联驻岛机场上起飞的飞机。
当时这些飞行目标在外围舰队的警戒雷达上暴露出后不到分钟，对手就大量地空投铝箔干拢带，干扰了雷达的监视。
一年战争后，美国方面吸收了英国人和本国太平洋海战惨败的教训，花了大力气在新式雷达的研究，并成功地开发出变频雷达，对铝箔干扰有很强反干扰能力。警戒舰队很快通过调频避开干扰，并通知了阿图拉岛方向作好夜间防空袭准备。
然而还没有等警戒舰队向阿图拉岛发送警报电报，那枚十万吨级别的原子弹就在阿图拉岛零海拔高度被引爆。剧烈核爆将岛上的一切暴露在地面的防空设施、陆基飞机全部摧毁殆尽。核爆产生的EMP全频带阻塞，更造成了这里和外界的无线电通讯联络被中断了近半个小时。
在1946的时候，航母在通常情况下，是不会派出夜间战斗机进行防空作战。
在这个时代，舰载机一旦放飞，在夜间着舰或寻找航母是个大问题。为了让放飞的飞机着舰时能找到航母甲板降落，就必须点亮大灯照明指示，在潜艇出没的海域这简直是找死的行为，同时点亮大灯，也等于是在告诉对手，我在这里，快来炸我吧。
而布在外围的警戒舰，虽然也有空母随行，但这些都是护航航母，数量不多，舰机量少，战术上和技术上，护航航母要放飞大量的夜间战斗机去拦截对手的夜间轰炸机都不可能。而对于飞行员来说，夜间空战和白天空战完全是两回事，前者飞行员更难培养，对飞机的性能也有额外的要求。即使是航母远离陆基机场出击时，夜间防空任务也是交由正式的战斗航母上的舰载机担任的。（注：历史上美国人是开发出F4U夜间型担任舰上夜间空战任务，但实际上日本飞机当时不具备夜间搜索攻击美军舰队的能力，最后F4U夜间型通常只用于岛基机场的夜间防空）
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