后面的明军也压了上来，用国姓瓶对堵路的民壮和辅兵进行爆破，炸得清军血肉横飞，刚刚筑好的墙壁也被炸得崩裂了一大片。
有清军要退却的，马上就被身后的军官一刀砍下了脑袋。
“杀！”为了死守杭州，清军也已经是豁出去了，大批的清兵涌了过来，硬生生的挡住了正在攻击的明军。
“快点上！把海寇赶出去！”祖泽清看到涌入缺口的清军越来越多，似乎看到胜利在望。只要把明军驱赶出去，就能堵住被炮弹砸开的缺口，杭州城还能守。
就在此时，一名清兵带着哭腔指向南面：“大人，南面！看南面！”
南面的杭州城墙上，绿色的清军绿营旗不知何时已经落在地上，变成了任人践踏的垃圾，一面火红色的大明旗冉冉升起。
原来，郑成功采取的办法是炮击城墙和蚁附攻城同时展开。明军用臼炮轰开一段缺口，把城内清军的注意力都集中到缺口这边来，郑成功却趁机让蔡政带着一批精锐战兵，趁着清军不注意登上城头。
登城之后，蔡政带着明军以迅雷不及掩耳之势击溃了城头的清兵，迅速占领了城头，撕掉了清军的旗帜，换上明军旗帜。
“城破了！”惶恐之极的惨叫在守军队伍里此起彼伏，堵住缺口的清兵感觉自己两腿开始发抖，纷纷扔了兵器扭头就跑。本来站在他们身后应该立刻弹压的清军军官们此时也正呆如木鸡，盯着那鲜红的旗子，手里的刀一样在抖。
涓涓细流很快就汇成了山崩地裂般的崩溃，面对缺口里压过来的郑家军，这些清兵再也没有任何死战的勇气和理由，纷纷扭头就跑。
士气往往都是此消彼长的，清军的崩溃，更是激发了明军高昂的士气。
城头被占领，缺口也被攻了进来。
“挡不住了！快跑！”祖泽清第一个逃命。
杭州将军卓内喇哈代、浙江巡抚朱昌祚、浙江总督赵廷臣，纷纷转身就跑，只留下了可怜的杭州知府。可怜的知府大人他不能逃命的啊，清廷的失土之罪可不是闹着玩的，若是知府大人在城破之后跑了，那等待他的是诛连九族的下场。于是杭州知府一个人回到自己的府中，让衙役们点燃了仓库之后，就拔剑自刎，结果了自己的性命。
卓内喇哈代带着一群八旗兵，在杭州城内四处趁火打劫。既然城已经破了，那就最后捞一把再走人。
“进去，抢！”卓内喇哈代站在一家珠宝店门口喊道。
如狼似虎的八旗兵冲入珠宝店内，把里面值钱的东西一洗而光，最后离开之前，又点燃火把，烧毁了这座珠宝店。
杭州城内最繁华的商业区，此时已经变成了人间地狱。到处都是熊熊火光，八旗兵和绿营溃兵们趁着城内乱成一团的机会，四处打劫。曾经他们经常光顾的窑子，还有那些轮不到普通小兵光顾的“高级娱乐场所”都成为清兵洗劫的目标。哪怕是那个令卓内喇哈代极为眼红的头牌，这时候他也没心思上了，只是抢光了这些女子身上的财物就跑路，如果碰到那个不开眼的人不肯配合的，上前就是一刀。
“主子爷，我们得赶快走，要不然就来不及了！”一名八旗兵对卓内喇哈代说。
卓内喇哈代冷笑：“我们怕什么！一会儿我们可以骑马离开！贼人没有骑兵，我们骑马出了城他们就追不上了！”
八旗兵在杭州最繁华的商业区狠狠洗劫了一番，随后八旗兵就骑马从艮山门逃出。
再说赵廷臣却是带着人，从武林门水门撤走。
武林门水门，驻守在城头的清军早已四散逃命去了，水门的闸门大开。当汉八旗水师乘坐的小船从河道经过的时候，两岸大批的绿营清军哭喊着要上船。
“让我们上船吧！”
“求求你们了，带我们走吧！”
“各位大人，行行好吧！”
赵廷臣吼道：“别理这些人！我们走！”
绿营兵见到“官老爷们”丢下自己，有的人怒从胆边生，张弓搭箭，就向正在逃窜的汉八旗水师船只射箭。
“还敢放箭射我们？杀了他们！”赵廷臣大怒道。
小船上的清军水师纷纷射出一排排乱箭，羽箭扎入人群中，顿时血光四溅，两岸哭喊的绿营兵发出一片惨叫声，不是落在河中，就是倒在血泊中。
清军的船只从水门冲出，进入运河。船上的汉八旗兵拼命的摇动船桨，向北面划去。就在这个时候，突然两边河堤后面的树林中，冒出一排排明军弓箭手。只听到一声“放”的喝令声，不计其数的羽箭下雨一样射入小船中。
清军水师身上也是只有轻甲，遭到弓箭射击，顿时损失惨重。
“快放箭反击！”赵廷臣大吼道。
岸上的明军射来一阵阵火箭，清兵乘坐的小船开始起火燃烧。清军水师手忙脚乱的发起反击，可是有人取出弓箭，才发现弓弦都湿透了，还有人身上起火，被迫跳水逃生。
明军的乱箭和鸟铳弹丸下雨一样射来，大部分的清军水师被杀，赵廷臣却跳水逃走。
而在此时，动作最快的提督大人祖泽清早已不知去向，总督赵廷臣也跑了，可是卓内喇哈代却未能逃走。他的八旗军刚刚从艮山门逃出，就遭到了明军的伏击。
埋伏在大道两边树林中的明军拉起绊马索，卓内喇哈代动作敏捷，及时拉起了战马，但和他并行的十多名八旗兵被绊马索绊倒。与此同时，树林中乱箭齐射，卓内喇哈代和五百多名满蒙八旗全部被射成了刺猬。
歼灭了清军八旗兵，郑家军的骑兵追击逃跑的清军步兵。跑得比较慢的朱昌祚和一群小兵一起，被明军抓住。此时朱昌祚身上穿着小兵的号衣，混在俘虏人群中，想要蒙混过关。
明军大营内，杨祖等人献上了卓内喇哈代和八旗兵的首级。
“这杭州城内那么多大鱼，就抓住了一条？”郑成功微皱起眉头。对这样的战果，郑成功感觉很不满意。
“回王爷，我们俘虏了一万多绿营兵，还有八千多民壮和七千多辅兵。”刘国轩拱手道。
郑成功道：“这些俘虏都送去东番岛去当苦力！我们那边开拓军垦田，需要人手！”
听说要被送去海外蛮荒之地当苦力，而且之前朱昌祚也听说过，被郑家军俘虏，就要送到海外去当苦力，不知道猴年马月才能回来，于是鼓起勇气站了出来：“我就是你们要找的浙江巡抚，你们不能把我送去海外蛮荒之地。”
“终于自己站出来了！”郑成功冷笑道。
“士可杀不可辱！老夫战败了，要杀要剐随你们便！”朱昌祚昂起头道。
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