虽然生物科研组发现了生物文明的真相，但是这又引来更多的疑问，比如吴董怎么在几千年前，就将灵魂打入到生物之中？难道真的是用气功？
比如根据吴董的谈话内容，貌似吴董早已经知道，生物文明具备灵魂这个特性，那他怎么知道的？从一开始就知道？
科学研究本身就是一个探究秘密的工作，如果这还是一个探究大老板秘密的工作，那么绝对会更加激发科学家们的研究热情。在这种热情的激励之下，科研组不断将研究向更深入的层次上推进。
灵魂基本理论构建完成，灵魂粒子、精神力、情绪情感这三者的关系基本明确，当科学院进展到这一步，另外一个问题就浮现在科学院面前——那就是灵魂的意识问题。
既然灵魂粒子的震动为情绪，那么意识与灵魂粒子的关系呢？
从科学院的实验来看，智慧生命处在灵魂状态时，是具备很清醒的主体意识的，它的逻辑思维能力，它的决策判断能力，它的情绪情感反应都是非常正常的。就是说灵魂依靠灵魂粒子的作用，应该能够提供意识的载体。
可是这本身和人类一贯的认识相悖，因为在人类惯常的概念里，所谓情绪和情感，是人体的内分泌活动和大脑活动的产物，具备很强的化学反应基础。这一点不断被人类的医学和生理实践在证明着，比如各种镇定剂可以很好的阻断情绪的化学反应，导致人的情绪始终平静而没有起伏。
类似的生理和医学认知清晰无误的告诉人类，情绪是生物化学反应的结果，情感是人类大脑各种电化学反应的结果。而人类意识的载体，无可争议的就是大脑，是大脑皮层的活动，是各种神经的联结反应，导致了意识的产生。
现在人类突然发现另外一个结论，意识、情绪、情感都是基于灵魂产生，这让科学院感觉分外的不可理解。从理论上来看，两个结论似乎都是对的，无论意识和情绪是源于生物化学反应，还是源于灵魂自身的运动，都有足够的理由支撑它成立。
但是按理说，两个理论是互相矛盾的，必有一个是正确的，一个是错误的，这恐怕就是科学院必须解决的问题了。
科学院还没有找到这个问题的答案，又有人在这个领域提出另外一个设想，这个设想是基于人类目前构建起来的灵魂基础理论的。既然灵魂是有灵魂粒子组成，而灵魂粒子又是某种无属性的能量粒子，那么在这种情况下，是否能够将灵魂进行反向还原？
所谓的反向还原，实际上就是将意识剥离出灵魂，将灵魂所蕴含的情绪和意识全部清除掉，将灵魂还原成最原始的纯态能量。如果人类的灵魂理论是成立的，那么这个操作按理说就应该是能够成立的。
并且这个灵魂反向还原操作，本身还有一个更为广阔的前景。如果人类能够从灵魂中提取出这种奇特的能量，必然会给人类带来更大的利益。简单来说，这种能量肯定能增加人类的灵魂强度，到时人类就可以像大黄蜂一样，不断增加自身灵魂的强度。
灵魂强度的增加肯定会带来很多附带的好处，虽然科学院现在还无法完全了解，但至少有一个很现实的好处，就是灵魂强度的增加，可以让人类免疫虚空蠕虫的侵袭。
并且灵魂这么特殊的东西，从其中提取出来的能量，必然相当的珍惜和高价值。虽然人类对这种能量还认识不充分，了解不透彻，但是并不妨碍人类明白这是个好东西。
所以这个想法一经提出，立刻得到不少科学家的支持，科学院开始投入力量进行专项研究。科学院很清楚，进行这种灵魂和意识的剥离实验，肯定会消耗海量的灵魂，这每一个灵魂都是一个活生生的智慧生命。
这事如果放在社会上，肯定会引起轩然大波，但是放在科学院里，反应就没有那么强烈了。因为科学家的伦理与常人是有很大不同的，对于常人看来不可思议，违背社会伦理的研究，在科学家的眼里，也许就是探索科学真理的必由之路。
如果把科学家视为另外一种宗教的信徒，那么他们的信仰就是科学真理，这个信仰往往是高于一切的，所有与这个信仰相悖的，都会受到遗弃。
除了科学院的群体性之外，吴辉一直以来对待外族的态度，也深刻影响着科学院在对待外族生命上的价值观。
宇宙是残酷的，这里是赤裸裸的适者生存优胜劣汰的种族竞技场，失败者失去一切，胜利者获得延续和存活。在这个宽广无比的角斗场里，没有任何的仁慈、道德、信用可言，从来没有过。
至少人类不如宇宙之后，所有经历的事情都说明，宇宙中根本就没有道德，宇宙种族之间的关系，只有一种关系，那就是生存竞争关系。如果消灭对方能够让自己过得更好，那么没有一个种族会犹豫。
所以宇宙种族之间的关系是赤裸裸的生存竞争关系，仁慈只会在种族之内存在。对于人类来说，外族的生命和鸡鸭的生命，和蚂蚁的生命，和鱼的生命没有任何区别。只要它对人类有价值，它也实现了那个价值，那么它的生命对人类就是有意义的，否则它的生命人类没有任何意义。
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